南京市对国家高新技术企业的补助根据各区政策不同，具体如下：

浦口区：对认定的高新技术企业一次性补助50万元；对重新认定的高新技术企业一次性补助30万元。

栖霞区：对省级或市级高新技术企业预备（后备）企业一次性补助20万元；对认定的高新技术企业一次性补助50万元。

此外，江宁区、六合区也有不同的补助政策。